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膜蛋白表達(dá)成功率接近100%?無細(xì)胞系統(tǒng)破解膜蛋白“表達(dá)魔咒”

更新時間:2025-11-21      點(diǎn)擊次數(shù):292

一、膜蛋白:生命活動的“守門員”與藥物研發(fā)的“黃金靶點(diǎn)”

 

蛋白質(zhì)是細(xì)胞生命過程的重要執(zhí)行者,而膜蛋白所扮演的角色讓細(xì)胞得以成為生命的基本單元。從細(xì)菌到哺乳動物細(xì)胞,膜蛋白形成了眾多高度保守的蛋白質(zhì)家族,是生物膜功能的主要承擔(dān)者,除了完成生物膜兩側(cè)的物質(zhì)、能量和信息的傳輸,還擔(dān)負(fù)著生物膜的合成、穩(wěn)態(tài)維持等任務(wù),并且參與細(xì)胞之間及膜被細(xì)胞器之間的相互作用。正因?yàn)槿绱耍さ鞍着c多種人類疾病密切相關(guān),并且是直接的藥物靶標(biāo)。

 

膜蛋白表達(dá)成功率接近100%?無細(xì)胞系統(tǒng)破解膜蛋白“表達(dá)魔<font class=

圖1: 典型β桶型膜蛋白E. coliOmp-F的晶體結(jié)構(gòu)

 

然而,目前膜蛋白的研究仍然存在著較大差距:在人類基因組中,約30%的蛋白質(zhì)基因參與編碼膜蛋白(其余編碼水溶性蛋白質(zhì));但膜蛋白僅占蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(PDB)中沉積結(jié)構(gòu)的約 3.6%(根據(jù)截至 2021 年 11 月的 PDBTM 數(shù)據(jù)庫)。由此也可以看出膜蛋白的結(jié)構(gòu)和功能研究擁有著廣闊的發(fā)展空間。

 

二、結(jié)構(gòu)決定功能:膜蛋白的核心類型

 

膜蛋白分為錨定蛋白和跨膜蛋白(又稱為整合型膜蛋白),后者作為膜蛋白的核心亞型,對于所有生物體維持各種生物學(xué)功能至關(guān)重要,是物質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、跨膜信號傳遞等關(guān)鍵過程的主要執(zhí)行者。例如,離子通道、葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、G蛋白偶聯(lián)受體等均為跨膜蛋白,其功能直接決定了細(xì)胞與外界環(huán)境的物質(zhì)交換效率和信號響應(yīng)能力,也是后續(xù)深入研究膜蛋白功能與應(yīng)用的核心對象。

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圖2:膜蛋白分類

 

此外,具有天然構(gòu)象的全長膜蛋白因其結(jié)構(gòu)的特殊性和功能的不可替代性,使其成為連接細(xì)胞內(nèi)外信號與生命活動的核心樞紐,為揭示 “跨膜區(qū) - 胞內(nèi)區(qū) - 胞外區(qū)” 的相互調(diào)控機(jī)制提供關(guān)鍵依據(jù),補(bǔ)了截?cái)囿w研究的局限性。

 

三、跨越屏障:膜蛋白研究的三大挑戰(zhàn)

 

由于膜蛋白的高度疏水性使其容易在水環(huán)境中聚集,因此研究膜蛋白通常具有挑戰(zhàn)性,尤其是全長膜蛋白,獲取其完整結(jié)構(gòu),一直是結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域的巨大挑戰(zhàn)。

 

1.表達(dá)困難:當(dāng)利用傳統(tǒng)的細(xì)胞系統(tǒng)(如細(xì)菌、昆蟲或哺乳動物細(xì)胞)來表達(dá)膜蛋白時,其疏水的跨膜區(qū)很容易被識別為“錯誤折疊”,導(dǎo)致蛋白聚集、形成包涵體,甚至對宿主細(xì)胞產(chǎn)生毒性,最終無法獲得大量、正確折疊的蛋白。

2.提取與純化困難:為了將膜蛋白“提取”出來進(jìn)行研究,必須使用去垢劑來模擬其原生膜環(huán)境。這個過程非常苛刻,很容易破壞蛋白的天然結(jié)構(gòu),使其失去活性。提取出來的蛋白也不穩(wěn)定,容易變性或聚集。

3.結(jié)構(gòu)解析困難:經(jīng)典的X射線晶體學(xué)需要獲得高質(zhì)量的三維晶體。但對于構(gòu)象動態(tài)變化的全長膜蛋白來說,使其形成有序的晶體陣列極為困難。

 

這導(dǎo)致開發(fā)周期長、表達(dá)效率不穩(wěn)定、普適性差。對于需要快速驗(yàn)證的大量候選蛋白,傳統(tǒng)的細(xì)胞工廠無法進(jìn)行與之匹配的高通量并行制造。因此,亟需一種新的蛋白合成方式來擺脫活細(xì)胞的局限性。

 

四、破局之道:無細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)如何“另辟蹊徑”

 

無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成(CFPS)系統(tǒng)跳出了活細(xì)胞的限制,直接在體外利用細(xì)胞提取物合成目標(biāo)蛋白,如同將細(xì)胞內(nèi)的生命合成“生產(chǎn)線”搬到了“試管”中。合成體系開放,研究人員可自由調(diào)整離子強(qiáng)度、輔因子濃度;合成過程快速高效,且天然適配高通量操作,可在微孔板中并行合成與測試數(shù)十至上百個候選序列。此外,無細(xì)胞體系無生存壓力,可通過外源添加去垢劑或納米盤等成分,為膜蛋白提供類似天然膜環(huán)境的條件,有效維持其結(jié)構(gòu)和功能。

 

【技術(shù)實(shí)踐】:珀羅汀生物依托自主知識產(chǎn)權(quán)的無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù),膜蛋白表達(dá)成功率接近100%。通過在表達(dá)的體系中加入去垢劑或納米盤的方式保持膜蛋白的穩(wěn)定性,使得膜蛋白更易表達(dá)純化。我們成功表達(dá)過的膜蛋白包括細(xì)胞色素酶、呼吸鏈酶、ligand receptor等。

 

  • 無細(xì)胞+去垢劑平臺

通過在無細(xì)胞體系中直接添加去垢劑,可以為膜蛋白跨膜區(qū)提供疏水環(huán)境,輔助膜蛋白形成正確構(gòu)象,實(shí)現(xiàn)全長跨膜蛋白可溶表達(dá)。

 

跨膜蛋白表達(dá)

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圖3:七次跨膜蛋白

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圖4:四次跨膜蛋白

 

  • 無細(xì)胞+納米盤平臺

通過在無細(xì)胞體系中加入膜支架蛋白與磷脂,形成類似細(xì)胞膜的納米盤結(jié)構(gòu),可以使合成的膜蛋白直接組裝進(jìn)納米盤,高疏水性的跨膜區(qū)穩(wěn)定插入脂雙層,獲得高穩(wěn)定性、高活性、接近天然構(gòu)象的全長膜蛋白。

 

跨膜蛋白表達(dá)

 

跨膜蛋白表達(dá)

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圖5:七次跨膜蛋白

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圖6:四次跨膜蛋白


五、技術(shù)前景與展望

 

隨著無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)的成熟,其市場規(guī)模也在穩(wěn)步增長。QYResearch調(diào)研顯示,2023年全球無細(xì)胞蛋白表達(dá)市場銷售額達(dá)到了15億元,預(yù)計(jì)2030年將達(dá)到23億元。這一增長背后是制藥、生物技術(shù)領(lǐng)域?qū)焖俚鞍踪|(zhì)開發(fā)工具的迫切需求。

人工智能與無細(xì)胞蛋白合成的結(jié)合,正在進(jìn)一步加速這一領(lǐng)域的發(fā)展。AI已在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、序列生成與功能設(shè)計(jì)方面展現(xiàn)出強(qiáng)大威力,而無細(xì)胞體系則有潛力成為連接數(shù)字世界與物理實(shí)體的高效橋梁,將AI的海量設(shè)計(jì)方案快速轉(zhuǎn)化為可測試的真實(shí)分子。將人工智能的設(shè)計(jì)能力與無細(xì)胞體系的快速合成能力相結(jié)合,被視為突破蛋白質(zhì)工程瓶頸的關(guān)鍵。

作為一項(xiàng)技術(shù),無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng)正在重塑膜蛋白研究的格局。從VLP平臺、Nanodisc技術(shù)到我司的無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng),這些創(chuàng)新工具使科學(xué)家能夠在更貼近天然環(huán)境的條件下研究膜蛋白的結(jié)構(gòu)與功能。隨著人工智能與無細(xì)胞系統(tǒng)的深度融合,以及新方法的不斷涌現(xiàn),我們將有望揭開更多膜蛋白的神秘面紗,加速從基礎(chǔ)研究到藥物開發(fā)的轉(zhuǎn)化進(jìn)程,最終為人類疾病治療帶來新的突破。

 

參考資料:

1.膜蛋白結(jié)構(gòu)動力學(xué)(第二版);
2.Zhu, Jingyi, and Peilong Lu. “Computational design of transmembrane proteins.” Current opinion in structural biology vol. 74 (2022): 102381. doi:10.1016/j.sbi.2022.102381;

3.2024-2030年全球及中國無細(xì)胞蛋白表達(dá)行業(yè)運(yùn)營動態(tài)及發(fā)展?jié)摿ρ芯繄?bào)告。

 

 

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